甲鱼周身均可食用，但是有些人不喜欢甲鱼的内脏，因为觉得甲鱼的内脏有很多脏东西，而且腥味很重，所以就不喜欢食用。其实好的甲鱼是没有腥味的，在挑选甲鱼的时候一定要好好选择。不喜欢内脏也可以去掉，这个就根据自己的喜好来决定。
甲鱼又被称为水鱼，很多人都会把它等同于乌龟，它其实是龟鳖目鳖科软壳水生龟的统称。现在是餐桌上很受欢迎的美味佳肴，还能作为中药材入药，其具有诸多滋补药用功效，有清热养阴，平肝熄风，软坚散结，对肝硬化，肝脾肿大，小儿惊痫等作用。
甲鱼现在称为非常昂贵的滋补品，其营养价值非常高，不仅肉味鲜美，而且蛋白质含量高，甲鱼的肉具有鸡、鹿、牛、羊、猪5种肉的美味，故素有“美食五味肉”的美称。但是在挑选甲鱼的时候一定要看，背光呈青色的清水甲鱼比背壳呈黄色的黄沙甲鱼好;甲鱼尾部超出背壳的为雄性，反之为雌性，雄性比雌性的好。一般750克左右的雄性清水甲鱼为上乘，被蚊子叮咬过的甲鱼质量最不好。