泡泡战士特殊武器包括水炸弹等具有趣味性功能的武器，如果使用得当可产生意想不到的效果。
1.水炸弹EO1
水炸弹EO1是最早的正是意义上的水炸弹，该武器的制作上使用了Ethi的分子压缩技术。该武器爆炸时会有高压水分向四面八方喷射而出，被击中的敌人会被冲击力道抛向远处，并处于短暂的眩晕状态。
2. 水炸弹EO2
最初的水炸弹EO1从扔出以后至爆炸时刻有段不小的时间间隔，任何有能力的战士均可逃过其伤害。而水炸弹EO2在继承水炸弹EO1优点的同时，通过改良水炸弹上端的压力调节雷管缩短了爆炸所需时间。
3.吸附式炸弹EO1-S
曾与僵尸王陷入苦战的Ethi改良了水炸弹EO1，在其身上安装了具有强力吸附能力的小吸嘴。战斗中扔出该炸弹后，其能粘在敌人身上而不至于丢失目标。
4.地雷MO1
一直以来，与Ethi一样拥有高超技术实力的Mos想要开发自己独有的水炸弹。终于有一天，Mos制作出了一踩即爆的地雷MO1。